这个时空的固拉多和盖欧卡已经被超魔神胡帕控制，这也是坂木的信号，这个世界本土的传说精灵将不会影响到他们的脚步，两人都在各自时空成功以对应宝珠融合自身，控制了固拉多和盖欧卡，所以如今的芳缘，他们便代表着大自然。
熔岩队与水舰队的露面，让各地的道馆训练家纷纷出动，前任冠军大吾和现任冠军米可利，也兵分两路，开始前往两大组织所在。
神奥地区。
时空双龙被召唤走后，身边站立着来自另外一个时空的帝牙卢卡和帕路奇亚的赤日平静无比。
他来自一个“成功以帝牙卢卡和帕路奇亚创造出了一个没有心存在的完美世界的时空”，原本赤日觉得自己已经完成了理想，可是他却没有想到，世间上还有无数个平行时空，彩虹火箭队的到访，让赤日明白了自己不能停下脚步，不然他创造的美好世界，迟早会被那一个个野心家毁灭。
“希望不会有人来阻止我吧，”赤日遥望天空。
彩虹火箭队几人，都有着自己的理想，这些野心家的理想大多对立，各自自然不可能和平共同，加入彩虹火箭队，也只是不愿意落后对手，每个人都觊觎着彩虹火箭队的技术，坂木的地位，正如坂木所说，他无法压制每个人，彩虹火箭队的形成，代表着一场更残酷的博弈。
合众地区的魁奇思更是如此，他在原本的世界收服了捷克罗姆和莱希拉姆，实力极速膨胀，加入彩虹火箭队的最大野心，就是想要操控坂木代替Ｎ作为自己的傀儡。
对于这片新的合众，魁奇思很满意，这里会是等离子队一步步吞并彩虹火箭队的起点，不过在那之前，需要清理一些碍事的人，这样才能把这个合众占领，让其成为等离子队的新领地，也只有如此……
他才有资格去与另外五个人博弈。
坂木、赤焰松、水梧桐、赤日、魁奇思、弗拉达利，六个人各自代表了一方势力，代表了不同的理念。
他们之间不可能互相认可，互相信服，所以这个世界会成为他们博弈的战场。
而这个世界的精灵联盟，这个世界的训练家，显然没有被后五人看在眼里，或许是他们那个时空的联盟过于无能，或许是因为他们如今的力量过于庞大……又或许是之前的经历，给了他们的信心。
但是面对这些穷凶恶极的野心家，精灵联盟却不能坐以待毙，道馆训练家也好，四天王也好，冠军也好，全部出动，甚至一些民间的训练家，也都纷纷站了出来，加入到了抵抗的大军中。